MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus islandicus L.D.8.5 plasmid pLD8501

Total Repeats: 671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013770	AT	3	6	65	70	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013770	TAG	2	6	139	144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013770	TTGA	2	8	188	195	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013770	ATT	2	6	293	298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013770	GTT	2	6	304	309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013770	CTTT	2	8	315	322	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013770	TTG	2	6	345	350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013770	AT	3	6	380	385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013770	TCT	2	6	401	406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013770	AGG	2	6	469	474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013770	ATT	2	6	515	520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013770	TTTA	2	8	544	551	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013770	TCA	2	6	560	565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013770	TTA	2	6	699	704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013770	TCT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013770	ATC	2	6	724	729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013770	TAG	2	6	752	757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013770	ATA	2	6	818	823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013770	TTCA	2	8	865	872	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013770	GTT	2	6	903	908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013770	GAAA	2	8	985	992	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013770	ATG	2	6	1094	1099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013770	GAT	2	6	1117	1122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013770	CTT	2	6	1206	1211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013770	T	6	6	1210	1215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013770	TCA	2	6	1305	1310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013770	AG	3	6	1332	1337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013770	A	6	6	1385	1390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013770	ATC	2	6	1416	1421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013770	AGCC	2	8	1437	1444	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013770	GCA	2	6	1446	1451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013770	ATA	2	6	1452	1457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013770	AGT	2	6	1494	1499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013770	ATG	2	6	1533	1538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013770	TAG	2	6	1574	1579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013770	ATA	2	6	1637	1642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013770	GAA	2	6	1655	1660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013770	AGG	2	6	1667	1672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013770	TGC	2	6	1688	1693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013770	TTG	2	6	1694	1699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013770	ATG	2	6	1716	1721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013770	GTA	2	6	1728	1733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013770	TTA	2	6	1734	1739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013770	CTGCAG	2	12	1747	1758	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013770	ATA	2	6	1768	1773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013770	GTA	2	6	1789	1794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013770	T	6	6	1810	1815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013770	AGT	2	6	1828	1833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013770	CTT	2	6	1863	1868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013770	TCT	2	6	1887	1892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013770	ATTT	2	8	1893	1900	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013770	AAAG	2	8	1926	1933	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013770	TAT	2	6	1966	1971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013770	TAA	2	6	2033	2038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013770	AGA	2	6	2049	2054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013770	AGGA	2	8	2075	2082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013770	TAT	2	6	2107	2112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013770	T	6	6	2112	2117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013770	ATT	2	6	2173	2178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013770	TTC	2	6	2192	2197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013770	CAA	2	6	2260	2265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013770	CACC	2	8	2314	2321	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_013770	AGA	2	6	2340	2345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013770	A	7	7	2354	2360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013770	TTAA	2	8	2368	2375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013770	ATT	2	6	2376	2381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013770	ACTT	2	8	2390	2397	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013770	CCT	2	6	2423	2428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_013770	TA	3	6	2467	2472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013770	CGT	2	6	2478	2483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013770	GCT	2	6	2494	2499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013770	TGCC	2	8	2559	2566	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013770	ATATT	2	10	2613	2622	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013770	TC	3	6	2631	2636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013770	CTA	2	6	2637	2642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013770	T	6	6	2673	2678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013770	TGC	2	6	2693	2698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013770	CTTAT	2	10	2726	2735	20 %	60 %	0 %	20 %	284807104
79	NC_013770	AGA	2	6	2748	2753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807104
80	NC_013770	GGTT	2	8	2761	2768	0 %	50 %	50 %	0 %	284807104
81	NC_013770	TTTC	2	8	2870	2877	0 %	75 %	0 %	25 %	284807104
82	NC_013770	TTC	2	6	2923	2928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807104
83	NC_013770	CTT	2	6	3003	3008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807104
84	NC_013770	AGA	2	6	3020	3025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807104
85	NC_013770	AAGAG	2	10	3026	3035	60 %	0 %	40 %	0 %	284807104
86	NC_013770	AAGA	2	8	3049	3056	75 %	0 %	25 %	0 %	284807104
87	NC_013770	ATG	2	6	3127	3132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284807104
88	NC_013770	TGAAA	2	10	3165	3174	60 %	20 %	20 %	0 %	284807104
89	NC_013770	TGC	2	6	3219	3224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284807104
90	NC_013770	AGG	2	6	3240	3245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284807104
91	NC_013770	A	7	7	3280	3286	100 %	0 %	0 %	0 %	284807104
92	NC_013770	CTTTT	2	10	3322	3331	0 %	80 %	0 %	20 %	284807105
93	NC_013770	AT	3	6	3368	3373	50 %	50 %	0 %	0 %	284807105
94	NC_013770	CTT	2	6	3401	3406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807105
95	NC_013770	TA	3	6	3446	3451	50 %	50 %	0 %	0 %	284807105
96	NC_013770	AATT	2	8	3466	3473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013770	GATA	2	8	3579	3586	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013770	TTG	2	6	3606	3611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284807106
99	NC_013770	ATC	2	6	3768	3773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807106
100	NC_013770	TAA	2	6	3810	3815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807106
101	NC_013770	TA	3	6	3891	3896	50 %	50 %	0 %	0 %	284807106
102	NC_013770	TAT	2	6	3938	3943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807106
103	NC_013770	TC	3	6	4035	4040	0 %	50 %	0 %	50 %	284807106
104	NC_013770	TTGAG	2	10	4076	4085	20 %	40 %	40 %	0 %	284807106
105	NC_013770	TCT	2	6	4093	4098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807106
106	NC_013770	GAA	2	6	4107	4112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807106
107	NC_013770	TCC	2	6	4137	4142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284807106
108	NC_013770	TTAG	2	8	4168	4175	25 %	50 %	25 %	0 %	284807106
109	NC_013770	TTCT	2	8	4201	4208	0 %	75 %	0 %	25 %	284807106
110	NC_013770	TCT	2	6	4234	4239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807106
111	NC_013770	TTATA	2	10	4298	4307	40 %	60 %	0 %	0 %	284807106
112	NC_013770	CGT	2	6	4310	4315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284807106
113	NC_013770	ATT	2	6	4318	4323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807106
114	NC_013770	TAA	2	6	4382	4387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807106
115	NC_013770	TTCA	2	8	4407	4414	25 %	50 %	0 %	25 %	284807106
116	NC_013770	TA	3	6	4424	4429	50 %	50 %	0 %	0 %	284807106
117	NC_013770	A	6	6	4459	4464	100 %	0 %	0 %	0 %	284807106
118	NC_013770	TAA	2	6	4511	4516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807107
119	NC_013770	TAA	2	6	4567	4572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807107
120	NC_013770	AT	3	6	4590	4595	50 %	50 %	0 %	0 %	284807107
121	NC_013770	CTT	2	6	4605	4610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807107
122	NC_013770	T	6	6	4609	4614	0 %	100 %	0 %	0 %	284807107
123	NC_013770	TA	4	8	4618	4625	50 %	50 %	0 %	0 %	284807107
124	NC_013770	CTA	2	6	4650	4655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807107
125	NC_013770	AT	3	6	4674	4679	50 %	50 %	0 %	0 %	284807107
126	NC_013770	TGT	2	6	4750	4755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284807107
127	NC_013770	AAT	2	6	4776	4781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807107
128	NC_013770	TTA	2	6	4788	4793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807107
129	NC_013770	TAT	2	6	4914	4919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284807107
130	NC_013770	TA	3	6	4935	4940	50 %	50 %	0 %	0 %	284807107
131	NC_013770	TCC	2	6	4949	4954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284807107
132	NC_013770	T	6	6	4959	4964	0 %	100 %	0 %	0 %	284807107
133	NC_013770	AT	3	6	5035	5040	50 %	50 %	0 %	0 %	284807107
134	NC_013770	AAT	2	6	5073	5078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807107
135	NC_013770	TCT	2	6	5085	5090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807107
136	NC_013770	TTC	2	6	5117	5122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807107
137	NC_013770	GA	3	6	5158	5163	50 %	0 %	50 %	0 %	284807107
138	NC_013770	TGATA	2	10	5190	5199	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013770	A	6	6	5219	5224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013770	TCT	2	6	5228	5233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013770	AGA	2	6	5399	5404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807108
142	NC_013770	A	6	6	5543	5548	100 %	0 %	0 %	0 %	284807108
143	NC_013770	ATA	2	6	5587	5592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807108
144	NC_013770	GAA	2	6	5599	5604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807108
145	NC_013770	CAT	2	6	5613	5618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807108
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147	NC_013770	ATTT	2	8	5776	5783	25 %	75 %	0 %	0 %	284807108
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411	NC_013770	AGA	2	6	16786	16791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807125
412	NC_013770	AGCTC	2	10	16807	16816	20 %	20 %	20 %	40 %	284807125
413	NC_013770	TGA	2	6	16828	16833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284807125
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431	NC_013770	ATCA	2	8	17781	17788	50 %	25 %	0 %	25 %	284807125
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434	NC_013770	TAAT	2	8	17961	17968	50 %	50 %	0 %	0 %	284807125
435	NC_013770	GAA	2	6	17984	17989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284807125
436	NC_013770	TAC	2	6	18049	18054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807125
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440	NC_013770	CTT	2	6	18127	18132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807126
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442	NC_013770	TGA	2	6	18144	18149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284807126
443	NC_013770	TTATAA	2	12	18185	18196	50 %	50 %	0 %	0 %	284807126
444	NC_013770	TAC	2	6	18215	18220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284807126
445	NC_013770	GA	3	6	18234	18239	50 %	0 %	50 %	0 %	284807126
446	NC_013770	TATAT	2	10	18242	18251	40 %	60 %	0 %	0 %	284807126
447	NC_013770	AT	3	6	18276	18281	50 %	50 %	0 %	0 %	284807126
448	NC_013770	TAA	2	6	18367	18372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807126
449	NC_013770	TTTC	2	8	18390	18397	0 %	75 %	0 %	25 %	284807127
450	NC_013770	TC	3	6	18400	18405	0 %	50 %	0 %	50 %	284807127
451	NC_013770	TTC	2	6	18406	18411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807127
452	NC_013770	AAT	2	6	18413	18418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807127
453	NC_013770	TTTC	2	8	18420	18427	0 %	75 %	0 %	25 %	284807127
454	NC_013770	AGAT	2	8	18439	18446	50 %	25 %	25 %	0 %	284807127
455	NC_013770	TAA	2	6	18451	18456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284807127
456	NC_013770	CATA	2	8	18483	18490	50 %	25 %	0 %	25 %	284807127
457	NC_013770	TTC	2	6	18500	18505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807127
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459	NC_013770	TA	5	10	18555	18564	50 %	50 %	0 %	0 %	284807127
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461	NC_013770	AAC	2	6	18571	18576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284807127
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471	NC_013770	TCTCTT	2	12	18774	18785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284807127
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474	NC_013770	TTTC	2	8	18840	18847	0 %	75 %	0 %	25 %	284807127
475	NC_013770	TTCTC	2	10	18848	18857	0 %	60 %	0 %	40 %	284807127
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478	NC_013770	GTAT	2	8	18904	18911	25 %	50 %	25 %	0 %	284807127
479	NC_013770	GAT	2	6	18925	18930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284807127
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481	NC_013770	TCT	2	6	19004	19009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
482	NC_013770	AAG	2	6	19041	19046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
483	NC_013770	A	6	6	19081	19086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_013770	TATT	2	8	19644	19651	25 %	75 %	0 %	0 %	284807128
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